树莓派 CM（计算模块） 上有一个 eMMC 设备连接在主 SD 卡接口上（Lite 版除外），下面将介绍几种方法，通过计算模块的 IO 底板将系统烧录到 eMMC 上。
你还可以在计算模块的 Datasheet 中查看到本文所介绍的方法。
首先需要准备一块树莓派 CM，和一块底板。CMIO 或者其他底板（如 ED-IOTGATEWAY）均可。
烧录步骤
你需要准备一个 Linux 系统（推荐使用树莓派或装了 Ubuntu 的 PC）或 Windows 7、Mac。
注意，对于 BCM2835 (CM1) 的 bootloader 有一个 BUG，它会给主机返回错误的 USB 数据包，但是大多数的 USB 主机会忽略这个无害的错误并能正常工作。这个错误在 BCM2837 中做了修正。
Windows 下的操作
在 Windows 下有一个安装工具来自动安装所需驱动和引导工具。或者你也可以使用 Cygwin 编译并手动安装驱动。
Windows 安装工具
1、下载并运行 安装程序 完成驱动和引导工具的安装。
2、将树莓派 CM 底板的 USB SLAVE 接口连上 PC 的 USB 接口。需确认 J4 跳线（USB SLAVE BOOT ENABLE）设定在 EN 的位置。
3、给树莓派 CM 底板上电，Windows 将自动发现新硬件并安装驱动。
4、驱动安装完成之后，运行 RPiBoot.exe。
5、等待几秒钟之后，计算模块的 eMMC 将作为 USB 大容量启动器出现在系统的磁盘列表中。
6、这时候就可以像 给 SD 卡烧录系统镜像 一样来给计算模块烧录系统了。在写入系统镜像时请将 J4 跳线设置到 disabled 的位置（或者不要使用 USB Slave 接口）。随后给底板上电，系统会从 eMMC 来启动。
Cygwin 手动安装驱动的方法
Cygwin 是一个在 Windows 平台上运行的类 UNIX 模拟环境，首先你需要在Windows 上安装好 Cygwin。
下载和安装参考 http://www.cygwin.com
接下来，和上面介绍的工具安装方法一样，设置好底板上 J4 跳线到 EN 的位置。用 micro USB 线把底板接到 PC 上，请不要给底板上电。
使用 Git 获取 rpiboot 的源码并编译安装。
sudo apt-get install git
如果系统时间没有设置的话， Git 会报错，使用下面的命令设置系统时间即可，此处 MM、DD、hh、mm 分别为月、日、小时、分钟。
sudo date MMDDhhmm
git clone –depth=1 https://github.com/raspberrypi/usbboot
cd usbboot
如果 libusb 没有安装的话，可以用下面的命令安装，若已安装则可忽略。
sudo apt-get install libusb-1.0-0-dev
编译源码
make
运行 rpiboot
sudo ./rpiboot
现在将计算模块底板的 USB Slave 接口（J15）连上 PC，并给底板上电。rpiboot 程序会检测到计算模块并发送启动代码来运行连接 eMMC。
Linux 下的操作
这部分和 Windows 下 Cygwin 的手动安装驱动方法类似。获取 usbboot 的源码并运行 rpiboot，所用到的命令和上面一样故不再赘述。下面说一下烧录这个步骤所用到的命令。
rpiboot 完成之后，你可以在 /dev/ 目录或者运行 lsblk 命令对比看到 rpiboot 运行前后的一些改变。会出现一个新的设备，就是计算模块的 eMMC。
使用 dd 命令将 Raspbian 镜像刷入到该设备即可。下面假设新的设备名为 sdX 则使用下面的命令。
sudo dd if=raw_os_image_of_your_choice.img of=/dev/sdX bs=4MiB
运行结果
/dev/sdX <- Device
/dev/sdX1 <- First partition (FAT)
/dev/sdX2 <- Second partition (Linux filesystem)
现在 /dev/sdX1 和 /dev/sdX2 可以被正常挂载到系统了。
在写入系统镜像时请将 J4 跳线设置到 disabled 的位置（或者不要使用 USB Slave 接口）。随后给底板上电，系统会从 eMMC 来启动。
来自：树莓派实验室